Hesaplamalı Kuantum Mekaniğinin Hesaplanması: 4 Adım

2024 Yazar: John Day | [email protected]. Son düzenleme: 2024-01-30 13:18

Kimya ve fizikteki hesaplama hesaplamaları, bazı numuneler üzerinde çok ilginç özellikler ortaya çıkarabilir (özellikle belirli bir orijinal bileşiğin daha iyi verimliliği için modifikasyona tabi tutulurlarsa). prosedürlerde, dipol moment, kararsızlık, elektrostatik potansiyel haritası, enerji diyagramı ve propabilistik reaktivite hesaplamalarının yanı sıra, hesaplamalı kuantum hesaplamalarının kullanılmasının laboratuvar süresini kısalttığı, olası bir bileşiğin sentezinin uygulanabilir olup olmadığını açık ve spesifik hale getirdiği prosedürlerde. ekonomik ve zamansal olarak söylüyorum.

Gereçler

• Kuantum
• Molekül modelleme.
• Moleküler orbitaller Orca Avogadro

Adım 1: Hesaplamalı Kuantum Mekaniği Hesaplaması - Avogadro

İlk adım olarak Orca yazılımı ile giriş imkanı olan Avogadro'yu indirin

Avogadro yazılımında moleküllerinizi oluşturmanız ve onları %99,9 optimize etmeniz garantilidir; Orca için giriş uzantıları kullanılırken sırayla uygun moleküler sıkıştırmayı garanti etmeyen Ctrl + Alt + o komutuyla çakışmaları önlemek için.

Molekülü optimize etmek için, önce ilgilenilen molekülü oluşturun (tabii ki), ardından E'ye tıklayın (bu E'nin altında bir aşağı ok olduğuna dikkat edin), böylece yazılımı içeren ekranın sol üst köşesinde benzer bir hesaplama görünecektir..

Adım 2: Yazılım Orca

Bu giriş düzgün bir şekilde yapıldığında, Avogadro yazılımına atıfta bulunarak uzantılar sekmesine tıklayın ve ORCA seçeneğini arayın

Giriş oluşturma ekranı açıldığında Gelişmiş'e tıklayın ve Tarih'te MO seçeneğini ve aşağıdaki ikinciyi işaretleyin. - İKİ İŞARET BIRAKIN - Orca'nın gerçekleştireceği kuantum hesaplamaları sırasında elektron yoğunluğunu ve aktive edilmiş moleküler orbitalleri elde etmek için - sadece giriş prosedürleri;)

Temel sekmesindeki bu prosedürden sonra, şu komuttan sonra tamamlayın:! RHF SP def2-SVP

kodu doğru / dikkatli giriniz…

! Normal baskı

% çıktı

[P_Basis] 2 yazdır

[P_MOs] 1 yazdır

son

DETAY, böyle bir işlem yapmadan önce Orca'yı indirip bilgisayarınıza kurun!

Yukarıdaki komutları gerçekleştirdikten sonra Oluştur ve böyle bir dosya kaydet'e tıklayın. Orca'nın kurulu olduğu klasöre girin. (Örnek: Orca'yı bilgisayarımın C sürücüsüne kurdum -> dosyayı bilgisayarınızın C sürücüsünün içine Orca klasörünün içine kaydedin).

Adım 3: Cmd Run'da…

Cmd'yi açın ve şunu yazın:

cd C: / Orca; Orca yazılımı bilgisayarınızın C sürücüsüne kuruludur …ve enter tuşuna basın.

Karşınıza bu bölümdeki resme benzer bir ekran gelecek, bu işlemden sonra komutun C: / Orca> yazısının yanında olup olmadığına dikkat edin. Bu komut doğruysa artı işaretinin (>) önüne komutu yazın.:

orca.exe (Orca klasörüne kaydettiğiniz molekülün adı).inp > (Orca klasörüne kaydettiğiniz molekülün adı).out

DETAY - KOMUTTA HİÇBİR Akraba YOKTUR VE SADECE MOLEKÜLİNİZİN ADI YOKTUR

Bundan sonra enter'a basın ve bekleyin … Benim durumumda komutu birkaç kez kaçırdım çünkü ilgili çokluk tek bir değer ve benim elektron sayım da tek, bu olursa Temel'de önceki adımda çokluk değerini 2 olarak değiştirin (Avogadro yazılımı).

Adım 4: Bir Dakika Bekleyin…

Komut verildikten sonra, cmd'nin bir sonraki komut satırında alt çizgi arayın

varsa, HARİKA, devam ediyor… Senaryo terimi görünene kadar biraz bekleyin:

cd: / Orca_

.out dosyanızın, Avogadro'da oluşturulan giriş dosyasının kaydedildiği Orca yükleme klasörü içinde oluşturulduğundan emin olmak için.

Orca'da cmd üzerinden hesaplama yapıldıktan sonra Orca klasöründeki.out dosyasını arayınız. Şu anda molekülünüzü (Avogadro) ve cmd'yi kapatabilirsiniz, sonunda kuantum hesaplaması yapılmıştır…

Bir sonraki adımda Avogadro'yu tekrar açın ve açılan sekmede oluşturulan.out dosyasını bulun ve açın; HOMO ve LUMO Orbital değerlerinin yanında molekülünüzün olduğunu göreceksiniz, sekmeyi biraz aşağı sürükleyin ve resimde görüldüğü gibi %100 civarında optimizasyon verecek orbitaller için hesaplamalar olduğunu göreceksiniz.

…ve eğlen…